Генетическое подтверждение предполагаемого диагноза «наследственный колоректальный рак» имеет большое значение для оказания медицинской помощи затронутым семьям. Однако многие из вариантов, выявленных в известных генах, в настоящее время не могут быть классифицированы с уверенностью в отношении их причинной роли в образовании опухолей.

Под руководством Института генетики человека при Университетской клинике Бонна (UKB) международная группа исследователей разработала критерии классификации, специфичные для генов, с помощью которых можно переоценить медицинскую значимость значительной доли неясных вариантов. Результаты исследования опубликованы в журнале Genetics in Medicine .

Семьи с наследственными опухолевыми синдромами подвержены высокому риску возникновения определенных видов рака, таких как колоректальный рак или рак молочной железы. Для многих более распространенных наследственных опухолевых синдромов доступны очень эффективные, интенсивные и ранние программы наблюдения и другие профилактические меры. Поэтому своевременное выявление и надежная диагностика наследственной предрасположенности чрезвычайно важны для затронутых семей.

Редкие варианты генов с неясной связью с образованием опухолей

Однако в результате все более всеобъемлющего генетического тестирования в ответственных генах обнаруживаются все более редкие генетические варианты , причинное значение которых для развития опухолей в настоящее время все еще неясно. Их называют вариантами неопределенного значения (VUS). В результате среди генетических вариантов, перечисленных в публичных международных базах данных (особенно ClinVar), в некоторых генах более 50% вариантов теперь являются VUS.

Возможное облегчение состояния носителей редких вариантов генов

В Центре наследственных опухолевых заболеваний UKB исследователи годами работают над выявлением новых генетических причин наследственных опухолевых заболеваний. С этой целью исследовательская группа под руководством профессора Стефана Аретца сотрудничала с международной и многопрофильной группой экспертов, состоящей из врачей и биологов. Группа разработала и проверила конкретные критерии классификации для оценки вариантов в гене APC.

Наследственные генетические изменения в APC являются причиной семейного аденоматозного полипоза (FAP), одной из наиболее распространенных причин наследственного колоректального рака или наследственного полипозного заболевания желудочно-кишечного тракта. «Разработанные критерии геноспецифической классификации позволят переклассифицировать значительную часть VUS гена APC в медицински значимую категорию», — объясняет Спайер. «Мы ожидаем, что большая часть VUS будет оценена как безвредные, редкие варианты. Это может затем избавить всех носителей этих вариантов во всем мире».

«Исследование стало возможным только благодаря нашему прекрасному всемирному научному сетевому взаимодействию и созданию международного комитета по оценке вариантов , которую мы провели, в частности, совместно с Международным обществом наследственных опухолей желудочно-кишечного тракта (InSiGHT) и Clinical Genome Resource (ClinGen)», — говорит профессор Аретц. «Я хотел бы подчеркнуть тесное сотрудничество с доктором Сяоюй Инь из Мельбурна, Австралия, во время ее шестимесячного пребывания в качестве приглашенного ученого в UKB».

Впоследствии исследователи из Бонна планируют провести обширное исследование по реклассификации, чтобы переоценить, если это возможно, все ранее известные VUS в гене APC с точки зрения их релевантности. Работа также послужит модельным проектом для аналогичных подходов с другими генами рака.

«Эти варианты не могут быть использованы для постановки диагноза, и их нельзя использовать для тестирования здоровых людей из группы риска; с другой стороны, они часто создают большую неопределенность, поскольку носители VUS могут быть подвержены повышенному риску опухолей», — говорит первый автор доктор Изабель Спайер из Института генетики человека. «Таким образом, выяснение причинной роли VUS в предрасположенности к раку напрямую способствует улучшению ухода за пациентами»
https://medicalxpress.com/news/2023-12-criteria-rare-genetic-variants-hereditary.html