Методы
Был произведен дифференциальный анализ OSBPL3, и была проанализирована корреляция между клинической стадией и OSBPL3. Множественный анализ был использован для сравнения взаимосвязи между выживаемостью пациентов и вариациями числа копий, однонуклеотидным вариантом и статусом метилирования. Были проанализированы различия в выживаемости между группами с высокой и низкой экспрессией OSBPL3. Были получены дифференциально экспрессированные гены (DEG) между группами с высокой и низкой экспрессией OSBPL3, и был реализован анализ функционального обогащения. Были проанализированы корреляции между иммунными клетками и OSBPL3. Сравнивали чувствительность к лекарственному средству между двумя группами экспрессии OSBPL3. Кроме того, экспрессия OSBPL3 была подтверждена с помощью иммуногистохимии и количественной ПЦР в реальном времени.
Полученные результаты
OSBPL3 по-разному экспрессировался в 13 опухолях и имел некоторые корреляции со стадиями T и N. Экспрессия OSBPL3 регулировалась метилированием, а более высокая экспрессия OSBPL3 была связана с более плохим прогнозом при КРР(колоректальный рак). Было получено 128 ДЭГ, которые в основном участвовали в активности активатора сигнальных рецепторов, метаболизме аспартата и глутамата. Гамма-дельта Т-клеток и фолликулярные хелперы Т-клеток значительно различались в группах с высокой и низкой экспрессией OSBPL3. Более того, OSBPL3 показал отрицательную корреляцию с несколькими препаратами. OSBPL3 значительно активировался в образцах КРР по сравнению с нормальными образцами.
Выводы
Всесторонний анализ показал, что OSBPL3 имеет потенциальную прогностическую ценность и руководящую значимость для химиотерапии КРР.
https://bmcgastroenterol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12876-023-02824-1
Add a Comment